領星發表學術論文,臨床基因組測序技術助力腫瘤患者個體化治療

2019-08-01 14:58 來源 : 中國基金網

  精準醫療時代來臨

  上海2019年8月1日?,前不久,領星與中國人民解放軍總醫院的焦順昌教授及其團隊合作撰寫的學術論文 "Using clinical genomic sequencing to guide personalized cancer therapy inChina"于 SCI 期刊Personalized Medicine發表。

  隨著分子靶向治療和免疫治療的發展,精準醫療時代已經來臨。精準醫療有時也被稱為“個體化醫療”,可以根據患者的基因組、生活習慣、風俗習慣和環境的不同,為患者量身定制疾病預防、診斷和治療服務,使患者在更有質量的生活狀態下獲得更可觀的臨床獲益。

  值得欣慰的是,現下對于腫瘤的認識日新月異,不斷有新的抗腫瘤靶點被開發,各類抗腫瘤新藥及新療法的臨床試驗數量呈爆炸性的增長。

  在這樣的大環境下,對于有限的腫瘤樣本,使用單基因或小 panel 的檢測或許會錯失許多潛在的有價值的信息。相較之下,全外顯子組測序(WES) 可以為腫瘤患者的診斷、治療和預后提供更為全面的信息,因為外顯子組雖然在人類基因組中的占比不到2%,但卻包含了約85%的已知致病變異。

  在這項研究中,領星對一千多例中國腫瘤患者的樣本進行了臨床全外顯子組測序(CWES),然后對其中成功檢測的953例中國腫瘤患者的突變特征進行了鑒定,并與 The Cancer Genome Atlas(TCGA)的 WES 數據進行了比對。此外,領星還對其中22例在前期治療中失敗的 IV 期腫瘤患者進行了長期隨訪,以評估 CWES 分析對臨床結果的影響。

  主要研究結果如下:

  中國患者的腫瘤類型分布情況

  中國腫瘤患者體細胞基因改變的頻率

  APC 和 KRAS 是導致結直腸癌發生突變的主要驅動突變,但在該檢測樣本范圍內突變率略低于 TCGA 的顯示結果。

  除 TP53外,在中國胃癌患者中未發現其它高頻突變。

  CDH1 是我國第二高發的體細胞突變基因,其突變頻率與 TCGA 報道的相似 (9.63% vs 10%),但 CDH1 在 TCGA 的報道中并不是主要的驅動基因。

  在肺鱗癌中,最常見的拷貝數改變 (CNV) 是 PIK3CA 的擴增和 CDKN2A 的丟失,與 TCGA 報道的差距不大。

  在中國肺腺癌患者中,EGFR 突變的發生頻率為45.97%,TCGA 報道僅為14.35%;KRAS 的突變發生頻率為11.41%,TCGA 報道為32.61%。這說明,中國肺腺癌患者的發病原因與國外患者不同。

  中國腫瘤患者CWES結果分析

  對953份 CWES 報告進行分析,結果顯示88.56%的患者有至少一個臨床可操作的體細胞突變;約40%的患者至少攜帶四種潛在的免疫治療預測生物標志物中的一種;約20%的患者被推薦使用已獲得相應適應癥批準的分子靶向藥物。也就是說,CWES 報告能夠為絕大多數的腫瘤患者提供臨床治療建議。

  CWES分析的臨床效益評估

  對22例接受 CWES 檢測的中國患者進行長期跟蹤隨訪的結果顯示,遵循CWES 分析結果接受后續治療的患者(A組)的中位無進展生存期 (PFS) 為12個月,較未遵循患者(B組)顯著延長,B組患者的中位PFS為4個月。45%的A組患者在這一輪治療中失敗了,而B組的失敗率為91%。

  綜合以上的研究結果可以一定程度上說明CWES 具有增加中國 IV 期腫瘤患者臨床獲益的潛力。這也是中國第一個評估 CWES 戰略臨床效益的研究。

  與2016年相比,截至2018年11月,CFDA 共增加了15種抗腫瘤藥物,更多的藥物被納入了醫保,也使得中國腫瘤患者有了更多的藥物選擇。在這種背景下,更多的中國腫瘤患者可以得到基于 CWES 分析匹配的藥物,也期待臨床基因組測序技術的推廣能為更多腫瘤患者帶來切實的獲益。

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